Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan2G3X952 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan2G3X952 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan2G3X952 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms