Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScaperF8VQ70 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScaperF8VQ70 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms