Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M1F7CXU4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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