Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8159E9Q0R1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8159E9Q0R1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms