Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-2D3Z4R4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms