Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms