Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms