Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhbdl2A2AGA4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms