Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms