Protein–RNA interactions for Protein: A0N8R1

Trav12-1, T cell receptor alpha variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-1A0N8R1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav12-1A0N8R1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-1A0N8R1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms