Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms