Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms