Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms