Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd2apQ9JLQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd2apQ9JLQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd2apQ9JLQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms