Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cml1Q9JIZ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms