Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r47Q9EQ51 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms