Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg7Q9D906 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg7Q9D906 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms