Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc8Q9D753 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc8Q9D753 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms