Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms