Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms