Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn3Q9CVD2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atxn3Q9CVD2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms