Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NepnQ9CQ76 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms