Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ska1Q9CPV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska1Q9CPV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms