Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms