Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms