Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GatbQ99JT1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GatbQ99JT1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms