Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rnf144aQ925F3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rnf144aQ925F3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf144aQ925F3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf144aQ925F3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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