Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clip1Q922J3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms