Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alg12Q8VDB2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms