Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2V2

Iffo2, Intermediate filament family orphan 2, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo2Q8R2V2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Iffo2Q8R2V2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Iffo2Q8R2V2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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