Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdc34Q8CFI2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms