Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms