Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp37Q8C0R0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Usp37Q8C0R0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp37Q8C0R0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp37Q8C0R0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp37Q8C0R0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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