Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx3Q80V91 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms