Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo41Q6NS60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fbxo41Q6NS60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo41Q6NS60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms