Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vat1Q62465 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms