Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tle1Q62440 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tle1Q62440 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms