Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms