Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall3Q62255 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall3Q62255 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms