Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntb2Q61235 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntb2Q61235 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms