Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms