Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxd4Q60688 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd4Q60688 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd4Q60688 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms