Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PtprnQ60673 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprnQ60673 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms