Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP170Q5SW79 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP170Q5SW79 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms