Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrc3Q5DU56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms