Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms