Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms