Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YOR082CYOR082C 342 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YIL169CYIL169C 2988 nt3.49□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 NUR1YDL089W 1455 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 DAP2YHR028C 2457 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 POL2YNL262W 6669 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 NRP1YDL167C 2160 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 MIX14YDR031W 366 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YEA4YEL004W 1029 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 FMP32YFL046W 624 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YGR026WYGR026W 837 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 AIM26YKL037W 357 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 DLT1YMR126C 1029 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YNL050CYNL050C 813 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RAS1YOR101W 930 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 PEX27YOR193W 1131 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YPR078CYPR078C 1119 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 IOC3YFR013W 2364 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YGL176CYGL176C 1665 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 KAP104YBR017C 2757 nt3.48□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 CUE3YGL110C 1875 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RCY1YJL204C 2523 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 DSE1YER124C 1722 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 IMH1YLR309C 2736 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 MTL1YGR023W 1656 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 LRG1YDL240W 3054 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 BCH1YMR237W 2175 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 AI3Q0060 1248 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 BSC2YDR275W 708 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RRT13YER066W 558 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 TAN1YGL232W 870 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YGL242CYGL242C 546 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YHR054CYHR054C 1065 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YJL175WYJL175W 513 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YOR238WYOR238W 912 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YPR077CYPR077C 372 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 CTP1YBR291C 900 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YPL109CYPL109C 1974 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 APM3YBR288C 1452 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 MSS4YDR208W 2340 nt3.47□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 YPR148CYPR148C 1308 nt3.46□□□□□ -1.85
LSP1Q12230 PRM15YMR278W 1869 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 snR83snR83 306 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 COX23YHR116W 456 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 GLG2YJL137C 1143 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 BUD21YOR078W 645 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PPT2YPL148C 522 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CIN2YPL241C 807 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 FAS1YKL182W 6156 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PFF1YBR074W 2931 nt3.46□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YDR442WYDR442W 393 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 WBP1YEL002C 1293 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YGR190CYGR190C 366 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PIR1YKL164C 1026 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YLR290CYLR290C 834 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 SUB1YMR039C 879 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 ECM13YBL043W 774 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YOR366WYOR366W 354 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YBR287WYBR287W 1284 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 BCS1YDR375C 1371 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CTM1YHR109W 1758 nt3.45□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CDH1YGL003C 1701 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 ITC1YGL133W 3795 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 POL3YDL102W 3294 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 DTD1YDL219W 453 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 DYN2YDR424C 279 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 IKI1YHR187W 930 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 MAK16YAL025C 921 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PCD1YLR151C 1023 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 FIG1YBR040W 897 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YDR089WYDR089W 2610 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CEP3YMR168C 1827 nt3.44□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 ECM21YBL101C 3354 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YGL152CYGL152C 678 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 PEF1YGR058W 1008 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 MPC3YGR243W 441 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YHL044WYHL044W 708 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 TPT1YOL102C 693 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YOR385WYOR385W 873 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 RIB5YBR256C 717 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 ACK1YDL203C 1872 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 SKN7YHR206W 1869 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 ISM1YPL040C 3009 nt3.43□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 INP52YNL106C 3552 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YLR108CYLR108C 1458 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 CPA2YJR109C 3357 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 GUK1YDR454C 564 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YIL024CYIL024C 570 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 MMF1YIL051C 438 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 RPS21BYJL136C 264 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 YMR310CYMR310C 954 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 SPH1YLR313C 1593 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 RDS2YPL133C 1341 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 EPL1YFL024C 2499 nt3.42□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 STP2YHR006W 1626 nt3.41□□□□□ -1.86
LSP1Q12230 BNA4YBL098W 1383 nt3.41□□□□□ -1.86
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