Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUDPQ08623 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms