Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rcn1Q05186 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms